Все моря, омывающие Магаданскую область, принадлежат к бассейнам Северного Ледовитого (Восточно-Сибирское и Чукотское) и Тихого (Охотское и Берингово) океанов.
Восточно-Сибирское море (площадь 901000 квадратных километров) расположено между Новосибирскими островами и островом Врангеля. На западе оно граничит с морем Лаптевых, соединяясь с ним проливами Лаптева и Санникова, а на востоке — с Чукотским морем, сообщаясь проливом Лонга.
Чукотское море (площадь 580 000 квадратных километров) расположено между островом Врангеля, Чукотским полуостровом и Аляской. На юге оно граничит с Беринговым морем, соединяясь с ним Беринговым проливом.
Моря Северного Ледовитого океана являются окраинными морями и расположены на материковой отмели, поэтому неглубоки. Максимальные глубины достигают 150—160 метров. Мелководье и суровый климат создают условия для образования мощных льдов на длительный период. Поверхность льда бывает ровная или волнистая, но иногда нарушается торосами — беспорядочными нагромождениями льда высотой до 5 и более метров, образовавшимися в результате сжатия льдов. В июле-августе с повышением температуры воздуха и под воздействием более теплых вод рек прибрежные участки морей освобождаются ото льда.
В открытых пространствах плавают тяжелые льдины, размещаются сплошные ледяные поля, которые нередко служат местом посадки самолетов и работы советских полярных станций.
Берега морей Ледовитого океана изрезаны лагунами, отделенными от моря узкими песчано-галечными валами — косами. Имеются большие заливы: Чаунская и Колючинская губы. В Чаунской губе расположен остров Айон. В 150 километрах от побережья в Ледовитом океане расположен большой остров Врангеля и с ним рядом остров Геральда. Из крупных полуостровов выделяется Кыттык, омывающийся водами Чаунской губы и Восточно-Сибирского моря, и Чукотский полуостров, омывающийся водами Чукотского и Берингова морей.
Температура воды в морях Ледовитого океана даже летом отрицательная и колеблется от 0 до —1,5°, и только у побережья температура повышается до +2 — +5°. Средняя соленость воды — 30 граммов солей на литр. У побережья воды сильно опреснены, соленость падает до 22—24 граммов.
Приливно-отливные движения северных морей выражены неярко. Амплитуда между точками прилива и отлива небольшая и соответствует примерно одному метру.
Моря Тихого океана характеризуются большими глубинами. Они возникли в результате глубоких провалов больших участков суши по линиям разлома земной коры, где процесс складкообразования продолжается.
Охотское море (площадь 1590 000 квадратных километров) расположено на юге области, от Тихого океана и Японского моря отделено полуостровом Камчатка, Курильскими островами, островом Хоккайдо (Япония) и Сахалином. Наибольшие глубины располагаются в юго-восточной части моря. Максимальная глубина 3 816 метров.
Для Охотского моря характерны самые большие приливы и отливы в СССР. В Пенжинской губе они достигают 13 метров.
Вода в море имеет горько-соленый вкус. В одном литре воды содержится в среднем 30—34,5 грамма солей.
Температура поверхностного слоя воды летом 6—14°. Берега Охотского моря сильно изрезаны. Здесь располагается большой залив Шелихова с Пенжинской и Гижигинской губами, а также Тауйская губа с заливами Амахтонским и Одян и бухтами Нагаева и Гертнера.
Из крупных полуостровов побережья выделяются Тайгонос, Пьягина и Кони. При входе в Тауйскую губу располагаются остров Завьялова и остров Спафарьева.
Берингово море (площадь 2 304 000 квадратных километров) лежит между материковой Азией и Америкой. На юге цепи Алеутских (США) и Командорских (СССР) островов отделяют Берингово море от Тихого океана. Северо-Восточная часть моря мелководна, южная — глубоководна. Максимальная глубина достигает 4 773 метров. Приливы и отливы здесь меньше, чем в Охотском море. В фиордах Чукотского полуострова они достигают 2,5—3 метров.
Соленость воды колеблется от 27 граммов на севере до 34 граммов солей на литр на юге моря.
Температура поверхностного слоя воды в летнее время, как правило, 6—8°.
Берега Берингова моря сильно изрезаны заливами, бухтами, губами, много полуостровов и островов. Здесь расположены Анадырский залив и залив Креста, Анадырский лиман и бухта Угольная. На Чукотском полуострове — Мечигменский залив, бухты Провидения и Лаврентия.
Богат и разнообразен животный и растительный мир морей, омывающих Магаданскую область. Из растений встречаются водоросли, морские травы. Из животных широко представлены корненожки, губки, медузы, моллюски, осьминоги, морские ежи, крабы. Много рыбы и морского зверя. Некоторые породы представляют большую ценность в промысловом отношении.
Велико транспортное значение северных и тихоокеанских морей. Северный морской путь сыграл и играет важную роль в освоении Крайнего Северо-Востока. В северные порты Чукотки кратчайшим путем приходят и пароходы из Мурманска. В Магадан и на Чукотку из Находки, Владивостока и других портов они доставляют оборудование, строительный материал, продукты.
Осуществляется связь с дружественными нам странами Восточной Азии: Корейской Народно-Демократической Республикой, Демократической Республикой Вьетнам и др.