Кроме обычной нитчатой, или гифальной, формы, мицелий у многих грибов в цикле их развития или под влиянием неблагоприятных условий претерпевает различные видоизменения, связанные с уплотнением и срастанием переплетающихся гиф.
Из особых видоизменений мицелия следует отметить мицелиальные тяжи, ризоморфы и склероции.
Мицелиальные тяжи — это шнуровидные образования, состоящие из параллельно расположенных и часто сросшихся в продольном направлении гиф (например, тяжи у домового гриба). Более массивные тяжи с темноокрашенными наружными частями носят название ризоморфы: они типичны для гриба опенка, но встречаются и у других грибов. Усложнением мицелия является образование склероциев.
Склероций — это темное тело плотной консистенции, состоящее из тесного сплетения гиф, с малым содержанием воды (5— 10%) и с большим запасом питательных веществ (жира до 30%). По форме и размерам они могут быть разнообразными (округлые, в виде рожков, неправильной формы); размером от десятых долей миллиметра до 30 см в диаметре и 20 кг веса (тропический трутовик Polyporus sapuremaA. Moll.). Анатомическое строение склероциев довольно однообразно. Они представляют собой ложную ткань, или плектенхиму, состоящую из сплетения грибных гиф, делящихся только в одном направлении. Снаружи склероций покрыт корой, состоящей из одного или чаще нескольких слоев клеток с темными стенками, плотно соединенными друг с другом. Внутри находится белая сердцевина, имеющая характер или параплектенхимы, состоящей из изодиаметрических клеток, как в рожках спорыньи, или прозоплектенхимы, состоящей из удлиненных клеток, как в склероции Sclerotinia libertiana Fuck.
Степень дифференциации склероциев может быть различной. Склероций бывает дифференцированным, когда он образован исключительно гифами гриба и легко отделим от ткани растения, на котором развивается гриб. Дифференцированные склероции имеются у Claviceps purpureaTul. Sclerotinia libertiana Fuck, и некоторых других. Недифференцированный склероций построен из видоизмененной, пронизанной гифами гриба ткани питающего растения. Это явление называется мумификацией плодов или других органов; например, возбудитель плодовой гнили Stromatinia fructigena Aderh., когда форма склероция повторяет форму плода яблока, вся мякоть которого пронизана его гифами.
Склероции служат стадией покоя или приспособлением для длительного сохранения и перезимовки гриба. После зимовки они прорастают и развивают сумчатые, базидиальные или конидиальные спороношения. У некоторых грибов склероции являются необходимым звеном в их цикле развития (возбудитель белой гнили моркови Sclerotinia libertiana Fuck., спорыньи Claviceps purpurea Tul.).