Из многочисленных условий, определяющих результативность скрещивания, к основным относятся: выбор пород, выбор отродий, линий, индивидуумов, возраст скрещиваемых животных, их пол, условия, в которых развиваются помеси и их родители, способ скрещивания.
Выбор пород. К скрещиванию прибегают лишь тогда, когда есть вероятность, что помеси окажутся лучше животных материнской породы. Для этого отцовскую породу подбирают или с явными преимуществами перед материнской или способную дать помесей, превосходящих по качеству животных материнской породы вследствие удачного сочетания либо гетерозиса.
Выраженность гетерозиса зависит от степени различия между типами скрещиваемых пород, от степени их неродственности, а также от отдаленности географических зон, из которых взяты животные для скрещивания.
По А. В. Васильеву, при скрещивании кавказских тонкорунных овец с далекими от них по типу прекосами гетерозис был большим, чем при скрещивании с близкими по типу асканийскими баранами. Еще больший гетерозис наблюдается при скрещивании тонкорунных овец с неродственными им линкольнскими баранами. Скрещивание волошских овец с баранами тонкорунных пород вызывает более ярко выраженный гетерозис, если использованы тонкорунные бараны из других хозяйств.
Выбор отродий, линий, индивидуумов. При скрещивании на формирование наследственности помесей влияют не только признаки, свойственные породам, ной признаки, свойственные индивидуумам, линиям, отродьям. Производители, которые дают хороший приплод при чистопородном разведении, иногда оказываются лучшими и при скрещиваниях. Таким был, например, симментальский бык Лорд КС-62; чистопородные и помесные дочери его отличались выдающейся молочностью. Но бывает и так, что при скрещиваниях наилучший результат дают производители, большого успеха при спаривании с чистопородными матками не имевшие. От симментальского быка Титра («Терезино») в симментальском стаде не было получено выдающихся по молочности дочерей, а его дочери от коров белоголовой украинской породы оказались рекордистками.
У помесей от скрещивания жирномолочных сибирских коров с быками черно-пестрой породы (остфризы) жирность молока была намного ниже по сравнению с их матерями. От скрещивания же выдающегося быка черно-пестрой породы (эстонской) Сюрприза с коровами значительно менее жирномолочной белоголовой украинской породы были получены помесные коровы с повышенной по сравнению с матерями жирностью молока. Из них многие стояли по этому признаку даже выше сибирских помесей.
Большое значение имеет также выбор линий. Если скрещиванием с орловскими рысаками мелких местных кобыл преследуют цель получить более рослую лошадь, для этого больше подойдут жеребцы из линий Громадного, Ловчего, чем из линий Вармика, Корешка.
Возраст скрещиваемых индивидуумов. Возраст животного влияет на устойчивость наследственности. Животные зрелого возраста стойче передают свои признаки детям. При скрещивании хряков корнвальской (черной) породы с матками датской (белой) породы было отмечено (опыты Ф. Келлера), что с возмужанием хряков в их приплоде увеличивалось число поросят с пигментированной кожей и щетиной. Чтобы у помесей качества лучшей породы преобладали над качествами худшей, животных лучшей породы берут в зрелом возрасте, а худшей — по возможности более молодых.
Пол скрещиваемых индивидуумов. Скрещивания, для которых самца и самку берут попеременно из двух пород — сначала самца из первой породы, а самку — из второй, потом самца — из второй, а самку — из первой, называются реципрокными скрещиваниями (реципрокус — взаимный).
По В. Ф. Денисову, если мать из породы более примитивной, чем отец, у помесей преобладает гетерозис; если мать из более культурной, чем отец, формы, преобладает нарушение нормы развития. Самки яка, покрытые быками алатауской породы, нормально оплодотворялись, донашивали, их телята росли здоровыми, крепкими. Из коров же алатауской породы, покрытых яками, 10,4% абортировали, а 17% родившихся от них гибридных телят пало, хотя они и находились в лучших условиях по сравнению со своими реципроками. Вес при рождении гибридных телят от алатауских коров был на 9,3—10,9 кг, а в 18 месяцев на 53—99,2 кг ниже чем у гибридных телят от самок яков. Удой, несмотря на лучшие условия, у первых был также ниже, чем у вторых.
Условия, в которых выращиваются помеси и их родители. Результаты реципрокных скрещиваний во многом зависят от условий, в которых помеси и их родители развиваются в утробный период и после рождения.
И. В. Мичурин придавал существенное значение разнице в условиях выращивания взятой для скрещивания пары живых существ. Большая разница в этих условиях ведет к более сильному расшатыванию наследственности и лучше выраженному гетерозису. При межпородных скрещиваниях иногда специально приобретают производителей из отдаленных зон.
Создание помесям условий, близких к условиям, привычным для животных одной из исходных пород, благоприятствует развитию у помесей качеств этой исходной породы. По П. Н. Кудрявцеву, при скрещивании свиней крупной белой породы с ливенскими в зоне картофельного кормления лучшие результаты получаются у приплода от маток ливенской породы, приспособленной к такому типу кормления, а в зерновой зоне — у приплода от маток крупной белой породы.