В морфоструктурном отношении Индийский океан разделяется на западную и восточную части. Первой из них свойствен атлантический тип морфоструктуры.
Подобно Атлантическому океану к западу от Срединного Индийского хребта диагонально располагается ряд океанических котловин и разделяющих их подводных хребтов. Западная часть океана, которая в морфоструктурном отношении служит прямым продолжением материковых платформ Африки и Индостана, представляет собой неравномерно погрузившуюся на дно океана древнюю гондванскую платформу, расчлененную системой диагональных разломов. Известные находки гранитов на океанических островах подтверждают указанную принадлежность западной части Индийского океана к материковым структурам.
Срединный Индийский хребет и Аравийско-Индийской хребет, вероятнее всего, представляют собой тектонические образования, сходные со Срединным Атлантическим хребтом. На это указывает и их большое морфологическое сходство. По новым данным, котловина м. Игольного не является однородной, а разделяется подводным хребтом (сходным с Китовым хребтом) на две части. Обращает на себя внимание, что подводный хребет м. Игольного простирается в южном направлении к Антарктическому поднятию (хребту). К западу от островов Принс Эдуард открыт еще подводный хребет, который ограничивает с юго-востока Мадагаскарский бассейн и, наверное, представляет собой один из отрогов Срединного хребта. Новые данные по рельефу дна Индийского океана еще больше подчеркивают его сходство с морфоструктурой Атлантического океана.
Восточная часть Индийского океана выделяется большим однообразием подводного рельефа. На большой площади океаническое дно здесь слаборасчлененное. Впрочем, при современной изученности нельзя быть уверенным в том, что рельеф дна восточной части океана действительно столь однообразен. Согласно взглядам Фербриджа, дно Индийско-Австралийской котловины является древней платформенной структурой — глубоко погруженным кратоном. Вместе с тем известно, что в области, прилегающей к западной Австралии, развивалась палеозойская геосинклиналь. Значит, в состав глубоко погруженного кратона должны были войти и складчатые — геосинклинальные структуры западной Австралии. Судя по характеру расчленения океанического дна между Индийско-Австралийской котловиной и Срединным хребтом океана, здесь можно предполагать систему отрогов этого хребта, так же как и к западу от Срединного хребта. В таком случае сходство морфотектоники Атлантического и Индийского океанов становится еще большим.