Систематический курс дарвинизма открывается обзором фактов, свидетельствующих в пользу трансформизма. Дарвин основал свою теорию на почве большого числа фактов, отчасти известных ему по данным современной литературы, но главным образом лично им собранных за время его путешествия на «Бигле». Факты эти убедили его в явлениях трансформации видов и послужили ему отправным пунктом к построению теории отбора. В «Происхождении видов» они вошли в состав ряда глав (X—XIV), посвященных фактическому обоснованию теории эволюции.
Примерно в том порядке и в той форме, как это было сделано Дарвином, фактическое обоснование эволюционной теории вошло в практику науки под названием доказательств эволюции. После работ Дарвина они разрабатывались целым рядом других авторов. В своем классически чистом виде доказательства эволюции излагаются преимущественно в работах авторов XIX века, в период, когда еще приходилось действительно доказывать преимущества эволюционной теории в объяснении ряда биологических фактов, по сравнению с теорией творения (креационизм). Защитники эволюционной теории пользовались обычно следующим методом. Излагались ряды фактов основных биологических наук, которые затем оценивались в свете эволюционной теории и креационизма. В результате этой оценки (обычно добросовестной и вполне научной) доказывалось, что дарвинистско-эволюционная точка зрения дает биологическим фактам вполне естественное, и как подчеркивал Дарвин, однозначное, а потому и убеждающее объяснение, тогда как креационистская теория такого единого объяснения им не дает. Отсюда следует вывод о справедливости и доказанности эволюционной точки зрения.
В настоящее время подавляющее большинство ученых признает, что органическая эволюция есть объективное явление природы. Тем не менее надо владеть логикой доказательств эволюции. Их изучение позволяет конкретно ознакомиться с объектом науки об органической эволюции, т. е. с фактом эволюционного процесса. А это очень важно, так как отсекает в корне ошибочное представление, будто бы дарвинизм не имеет своего объекта исследования. Доказательства эволюции очевидно выявляют этот объект, и в этом их методологическое значение.
Как же следует строить доказательства эволюции? Со времени появления работ Дарвина установилось традиционное использование различных данных основных биологических дисциплин — палеонтологии, биогеографии, сравнительной анатомии, эмбриологии и т. д., которые свидетельствуют в пользу эволюционной теории. При таком обзоре доказательств эволюции получалось так, что дарвинизм, не имея, якобы, своего объекта исследования, черпает свои данные из ряда других наук, а не из собственной сокровищницы знаний. Классификация доказательств эволюции строилась не по-проблемно, а по признаку дисциплин, из которых они извлекались. Мы в нашем курсе построим доказательства эволюции по-проблемно. Что же именно нам предстоит доказать?
Прежде всего необходимо установить, что весь органический мир исторически целостен, пронизан чертами единства, т. е. имеет монофилетическое происхождение. Во-вторых, исходя из факта многообразия живых форм, нужно выяснить, что это последнее — прямой результат эволюционных преобразований организмов. Чтобы установить это, необходимо показать, однако, существование исторического процесса преемственных преобразований живых форм. Далее, для этой же цели нужно показать, каким же образом, в условиях монофилетического происхождения, возникло многообразие живых форм. Ведь это многообразие не может быть представлено в виде прямого ряда форм — от низших к высшим и, напротив, значительно естественнее отображается в форме «древа жизни», со многими одновременно существующими ветвями. Очевидно, что возникновение такого «древа жизни» естественнее всего представить себе, как следствие широкой дивергенции. Стало быть, нужно доказать факт именно дивергентной эволюции. Наконец, должно быть показано, что эволюционный процесс носит приспособительный характер, т. е. осуществляется через приспособление организмов к эволюирующим условиям среды.
Объектом дарвинизма является процесс органической эволюции. Но столь же ясно, что объект нашей науки, в его материальном выражении, реально осуществляется через его развитие и что последнее и есть объективное доказательство существования самого объекта. Органическая эволюция, как объективное явление природы, характеризуется: фактом преемственного исторического развития, явлениями дивергенции, фактом повышения организации и приспособительным характером эволюционных преобразований. Установление этих элементов характеристики эволюционного процесса естественно приводит к необходимости причинного объяснения его. В самом деле, факты эволюции приобретают свою полную достоверность только в свете трактовки эволюции, как биологической необходимости. Однако, эволюция, как необходимость, может быть материалистически обоснована только на почве причинного объяснения ее. Следовательно, полное обоснование объекта дарвинизма требует анализа факторов или причин эволюции.