Мероприятия против фузариоза направлены на проведение профилактических действий, выращивание здоровой рассады, уменьшение отрицательного влияния заражения растений патогеном.
Для посева отбирают семена только с растений без симптомов фузариоза. Почву в парниках обеззараживают термическим или химическим способом (так же, как при выращивании лаванды).
Перед посадкой рассады в грунт проводят ее жесткую браковку. Оптимальный срок высаживания рассады в поле конец апреля — май. Закладывают плантации базилика на полях севооборота с возвращением на прежнее место не раньше чем через 7 лет. Расстояние между рядами должно составлять 60-70 см. На 1 га размещают 50-60 тыс. растений. Уход за плантациями заключается в междурядных обработках, периодических прополках в рядах, поливах и внесении минеральных подкормок. Уровень агротехники в значительной мере определяет степень вредоносности фузариоза.