Наличие большого разнообразия во взаимоотношениях паразитов и растений-хозяев и паразитической активности у возбудителей болезней оказывает влияние на характер воздействия паразитов на клетки и ткани растений.
Эти различия в способе питания и характере воздействия паразита на растение обусловлены различиями в наборе ферментного аппарата, определяющего способ и особенности питания гетеротрофного организма. Здесь наблюдается ряд переходов — от полной гибели питающего растения под воздействием паразита до гармонического симбиоза.
Факультативные сапрофита и особенно факультативные паразиты, внедряясь в живую ткань растения, очень быстро убивают ее своими выделениями, причем зона отмерших клеток часто идет впереди зоны разрастания мицелия гриба, так что фактически гриб растет в мертвом субстрате. Это хорошо можно наблюдать, например, при поражении моркови белой гнилью (Scleroiinia libertiana Fuck.) или серой гнилью (Botrytis cinerea Pers.).
Наоборот, истинные паразиты, особенно наиболее приспособленные среди них облигатные, такие, как ржавчинные и мучнисторосяные грибы, имеют сравнительно узкий набор ферментов и оказывают гораздо более умеренное действие. Здесь паразит не только не убивает клетки растения-хозяина на известном расстоянии от мицелия, но даже непосредственное соприкосновение и внедрение мицелия или гаустории не сказывается на них губительно. Мало того, при этом наблюдается как бы известное повышение их жизнедеятельности: более зеленая окраска хлорофилловых зерен, скопление ассимилятов и др. Лишь позднее отношения меняются, и клетки хозяина начинают отмирать, что совпадает с окончанием роста мицелия и началом спороношения на нем.
Кроме того, облигатные паразиты, как мучнисторосяные и ржавчинные грибы, лучше развиваются на здоровых хорошо упитанных растениях, тогда как факультативные паразиты особенно нападают на ослабленные растения или такие части их, как плоды и овощи, которые сложены из клеток с ослабленной жизнедеятельностью, хотя и богатых питательными веществами. Поэтому такие паразиты нередко носят название паразитов ослабленных растений. Хорошим примером их может служить возбудитель серой гнили овощей и плодов (Botrytis cinerea Pers.).