В соответствии с различной паразитической активностью фитопатогенные бактерии различаются по специализации их в отношении растений-хозяев. Здесь также выделяются две группы.
К первой группе относятся высокоспециализированные бактерии, паразитирующие на растениях, принадлежащих только к одному роду или даже виду растений. Такие виды бактерий называются монофагами, или одноядными. К ним относятся: возбудитель гоммоза хлопчатника — Xanthomonas malvacearum Dowson, поражающий хлопчатник и близкие к нему виды рода Gossypium; возбудитель ожога шелковицы — Pseudomonas mori Stevens.
Вторая группа включает такие бактерии, которые способны поражать растения, относящиеся к различным семействам. Такие малоразборчивые в выборе растения-хозяина бактерии называются полифагами. Сюда относятся бактерии, поражающие ряд видов и родов одного семейства. Например, Xantomonas campestris Dowson — возбудитель сосудистого бактериоза капусты, приурочен к паразитированию на крестоцветных. Бактериями с широкой избирательной способностью, поражающими растения из различных семейств, могут быть: возбудитель мокрой гнили моркови, лука, томатов и других растений — Pectobacterium carotoworum Dowson; Xanthomonas heteroceae (Wsorow) Gorl, поражающая пшеницу, табак и еще 28 растений, относящихся к различным семействам, и пр.