Возбудитель инфекции отнесен к группе В арбовирусов.
Он малоустойчив к (выживанию вне живого организма в обычных условиях. Но при низких температурах, близких к температуре жидкого воздуха, может сохраняться в течение длительного времени.
В молоке при низкой температуре вирус сохраняется до 2 нед, в масле — не менее 2 мес. Легко культивируется на куриных эмбрионах.
К экспериментальному заражению вирусами клещевого и комариного энцефалитов восприимчивы мыши, обезьяны, хомяки, а к комариному энцефалиту также лошади, коровы, овцы, козы, молодые собаки, свиньи, кошки, особенно при внутримозговом заражении.