Поражает метелки. В отличие от пыльной головни разрушает завязь (чешуйки сохраняются). Темная споровая масса просвечивает через тонкие пленки семян, поэтому зараженные метелки легко заметить. Нередко встречается одновременно с пыльной головней овса.
Возбудитель болезни — Ustilago levis Magn. Отличается от U. avenae некоторыми морфологическими признаками (оболочка спор гладкая). Споры паразита, образующиеся в метелках в виде черной массы, склеиваются в плотные комочки, которые не распыляются и сохраняются под чешуйками. Во время уборки пораженные семена разрушаются, и комочки или отдельные споры попадают под цветковые чешуйки здоровых семян или на их поверхность, где и сохраняются в течение зимы. Заспоренные семена служат источником болезни. Заражение происходит в фазу проростка. Таким образом, развитие возбудителя покрытой головни и заражение растений происходит так же, как и при пыльной головне овса.
Борьба с покрытой головней, как и с пыльной, проводится путем протравливания семян.