В процессе инфекционного заболевания растения различают первичную и вторичную инфекцию, которая соответствует первичной и вторичной фазе развития болезни.
Первичной инфекцией называют такое заражение растения, которое вызывается спорами или другим источником инфекции и которое впервые обнаруживается в сезоне на одной или нескольких растениях одного и того же вида. Появление первичной инфекции какого-либо заболевания определенного культурного растения в каком-либо районе обычно связано с сохранением инфекционного материала в течение зимнего времени в различных формах или заносом его из других районов.
Вторичной инфекцией называют такое заражение, которое возникает от первых очагов той же болезни, появившихся ранее. Вторичная инфекция дает начало нескольким заражениям, вызываемым одним и тем же возбудителем. Эта инфекция связана с распространением инфекционного материала и способствует нарастанию болезни в данном районе. Примерами первичной и вторичной инфекции могут быть следующие.
Возбудитель спорыньи злаков — Claviceps purpurea Tul. зимует в виде склероциев в почве, где весной прорастает, образуя стромы с шарообразной головкой. В головке стромы формируются плодовые тела с сумками и нитевидными спорами. Во время цветения ржи зрелые споры гриба выбрасываются из плодовых тел, попадают на колосья ржи и вызывают первичную инфекцию, т. е. первый очаг заболевания. Появление первичной инфекции и первых очагов заболевания связано с наличием запаса склероциев в почве или в посевном материале.
На цветке ржи гриб развивает коиидиальное спороношение, выделяет сладковатую жидкость, которая привлекает насекомых, способствующих распространению конидий на окружающие растения. Заражение колосьев конидиями гриба и распространение заболевания является вторичной инфекцией. Здесь вторичная инфекция представлена конидиальной стадией гриба: она ограничена временем цветения растения-хозяина (ржи).
У других сумчатых грибов, где зимовка паразита совершается на отмерших частях растения, первичная инфекция листьев осуществляется от аскоспор, а вторичная инфекция и дальнейшее распространение болезни совершаются с помощью конидиальной стадии (парша яблони, плодовая гниль и др.).
При заражении ржавчинными грибами, у которых имеется несколько различных спороношений, первичная инфекция происходит от базидиоспор — у однохозяйных ржавчинников (ржавчина подсолнечника — Puccinia helianthi Schw.) или от эцидиоспор — у разнохозяйных паразитов (стеблевая ржавчина — Puccinia graminis Pers.). Вторичная инфекция осуществляется уредоспорами и может совершаться многократно, так как летние споры ржавчинных грибов в течение лета повторяются несколько раз (образуют несколько поколений), что приводит иногда к массовому заболеванию некоторых сельскохозяйственных растений.
Таким образом, для первичной инфекции характерно заражение, осуществляемое возбудителем, распространяющимся непосредственно из очагов его перезимовки, последующие заражения и распространение составляют вторичную инфекцию.
Выражению «вторичная инфекция» иногда в фитопатологии придается другой смысл и другое значение, а именно: при заражении растений одной болезнью часто создаются благоприятные условия для проникновения возбудителя другой болезни. Вот этот процесс инфекции растения, ранее зараженного первичным возбудителем болезни, возбудителем другой болезни, иногда называют вторичной инфекцией. Большую роль в развитии вторичной инфекции принимают факультативные паразиты, которые сопутствуют многим процессам заболевания клубней и луковиц при их хранении.
Время появления инфекции, как первичной, так и вторичной, оказывает большое влияние на развитие болезни и причиняемый ею хозяйственный ущерб. При позднем появлении инфекции, когда возбудитель болезни нападает на уже сформировавшееся растение и не может внести сюда глубокие изменения, наблюдается незначительный вред от болезни. При ранней же инфекции, когда паразит попадает на молодое еще растение или на несформировавшийся орган его, воздействие паразита на растение проявляется в наиболее сильной степени и заболевание причиняет наибольший ущерб.