Неблагоприятное влияние удобрений на окружающую среду может быть самым различным:
- попадание питательных элементов удобрений и почвы в грунтовые воды с поверхностным стоком приводит к усиленному развитию водорослей и образованию планктона, т. е. к эвтрофикации природных вод;
- потери азота в атмосферу отрицательно сказываются на деятельности сельскохозяйственных и других предприятий (ухудшается микроклимат и т. д.). Высказываются также опасения о возможном разрушении озонового экрана стратосферы вследствие проникновения в нее неполных окислов азота, образующихся при денитрификации азотных соединений почвы и удобрений;
- неправильное применение минеральных удобрений может ухудшить баланс и круговорот питательных веществ, а следовательно, и агрохимические свойства и плодородие почвы;
- нарушение технологии применения удобрений, несовершенство качества и свойств минеральных удобрений ведут к снижению продуктивности сельскохозяйственных культур и качества продукции.