Микрофлора в комбикормах по содержанию в нем большего количества питательных веществ он является исключительно благоприятной средой для развития плесневых грибов и бактерий.
В период хранения комбикормов количество микрофлоры быстро увеличивается, один видовой состав сменяется другим. Наибольшие изменения происходят при нарушении режимов хранения комбикормов.
При наличии достаточного количества влаги (на уровне критической и более и положительных температур выше 10 °С и особенно выше 20 °С) плесневые грибы быстро развиваются, выделяют много тепла и являются основной причиной самосогревания массы комбикормов. Установлено, что увеличение числа грибов, особенно в обогащенных комбикормах, происходит уже при относительной влажности воздуха 60%. Наиболее благоприятна для развития грибов относительная влажность 90 %. Введение в комбикорма витаминов, аминокислот, солей микроэлементов и дрожжей интенсифицирует развитие Aspergillus, Penicillium, Mucor.
Среди встречающихся в комбикормах грибов можно обнаружить и токсические виды — продуценты опасных для здоровья животных метаболитов, имеющих большое значение при санитарно-гигиенической оценке качества комбикорма. Большая скважистость рассыпных комбикормов (56…58 %) и гранулированных (50…54 %) обеспечивает запас кислорода, необходимый для интенсивного развития аэробной грибной флоры.
В комбикормах размножаются как сапрофиты, так и патогенные виды аэробных и анаэробных бактерий. Поэтому иногда сырье растительного и животного происхождения, входящее в комбикорм, может служить источником распространения возбудителей различных заболеваний животных. При хранении комбикормов, содержащих белковые добавки, в условиях высокой температуры и влажности быстро размножаются патогенные бактерии группы Salmonella.
Л. И. Карецкас, Е. И. Кострова (1978) изучали изменение количественного и видового состава микрофлоры в комбикормах с различной влажностью при: различных сроках хранения их в условиях разных температур. Исследования проводились на образцах рассыпного и гранулированного комбикорма для поросят-отъемышей, изготовленного по рецепту № 51-19. На опытное хранение были заложены комбикорма влажностью от 10 до 18 % при температурах 20, 10, 0 и —5 °С. Опытные образцы хранили насыпью в условиях, принятых в настоящее время в практике комбикормовых заводов.
Данные показывают, что интенсивное развитие микроорганизмов (грибов и бактерий) при повышении температуры и влажности начинается в более ранние сроки как в рассыпных, так и в гранулированных комбикормах. Как видно из таблицы, бактерий в рассыпных комбикормах во много раз больше, чем в гранулированных. Последнее объясняется действием высоких температур в процессе гранулирования. Комбикорм прогревается до 88—90 °С. Такие температуры губительны для большинства видов бактерий.
Существенной разницы в сроках наступления активного развития микроорганизмов у рассыпных и гранулированных комбикормов (в данном случае для поросят-отъемышей) не наблюдается, несмотря на резкое различие в численности микрофлоры.