Всходы и молодые сосенки очень чувствительны к заболеваниям, вызываемым различными грибами.
В большинстве случаев при заболевании пораженные растения отмирают. Особенно опасны для сосенок такие болезни: полегание и выпревание сеянцев, пожелтение хвои, искривление побегов.