Поражает лен во все фазы его развития. На всходах заражаются корни, на которых образуются штрихи или пятна от оранжевого до кирпично-красного цвета, кончик корня отмирает. Такие же пятна и на семядолях. При общем заражении растения отмирает точка роста; корни деформируются, на них образуются узловатые утолщения, напоминающие клубеньки бобовых. Такие растения прекращают рост и засыхают.
При заражении растений в период бутонизации также поражается точка роста. Верхушка растения увядает и засыхает, на растении образуются боковые побеги, и стебель становится ветвистым. Растения, пораженные в фазу бутонизации, обычно не образуют семян.
Бактериоз льна вызывается Bacillus macerans Schard. Инфекция распространяется главным образом через почву, сохраняются бактерии и на семенах.
Бактериоз — болезнь, распространенная в зоне культуры льна-долгунца. Болезнь развивается особенно сильно на вновь осваиваемых целинных, неокультуренных, плохо обрабатываемых, низинных, заболоченных почвах с пониженной кислотностью. На старопахотных землях бактериоз развивается в случае избытка извести. Способствуют развитию бактериоза избыточная влажность в период всходов и засуха в период бутонизации.
Меры борьбы. В борьбе с бактериозом имеют большое значение следующие мероприятия: хорошая обработка почвы; внесение органоминеральных удобрений и микроэлемента бора (предпосевное и при подкормке); протравливание семян.